视情况而定。支付宝公交卡用哪里的钱，要看用户支付宝的付款设置，通常是以支付宝余额优先付款。付款途径包括：“余额”、“余额宝”、“花呗”、银行卡。用户可手动进入支付宝，设置扣款方式或扣款顺序。

城市中乘坐公交车时一般都使用IC卡。有专门的公交卡，也有和银行卡合用的公交卡，即既可以当银行卡使用，也可以当作公交卡使用。目前还有和手机SIM卡放在一起的移动公交卡。在公交车上可以刷手机消费，出门不再需要带一堆的散钱，既方便又时尚。

2015年1月15日，交通运输部出台《关于全面深化交通运输改革的意见》。《意见》称交通部研究制定智慧交通发展框架，实现ETC、公共交通一卡通等全国联网。